病理生理学是研究疾病发生的原因、条件、患病机体的功能代谢变化及其发生机制 的科学，其任务是揭示疾病发生、发展与转归的规律，阐明疾病的本质，为疾病防治提供理论依据。病理生理学属医学基础课程，是沟通基础医学与临床医学的桥梁学科，也是多学科相互渗透而形成的 独立学科。病理生理学教研室承担八年制、七年制临床医学、五年制医学本科及成教等多层次的病理生理学教学任务，并为研究生及七年制开设“高级病理生理学”、“临床病理生理学”等课程。在承担教学工作的同时，教研室开展败血症休克与全身炎症反应综合征、心血管分子病理生理等领域的科学研究，承担培养博士研究生、硕士研究生及进修生的任务，是“病理学与病理生理学”国家重点学科的组成部分之一。

    病理生理学教研室始建于1954年，创始人为我国著名病理学与病理生理学家潘世宬教授，参与建室的还有罗智质、陈国桢、罗正曜、姚开泰、孙去病、文尚武、胡友秋等老师。1966年文化大革命开始后，病理生理学教研室被撤并，1978年文革结束后重新组建。党的十一届三中全会以后，国家政治经济形势稳定，病理生理学教研室获得了快速发展 。于1984年分为两部分—病理生理学教研室和肿瘤研究室，病理生理学教研室在罗正曜教授的领导下，主要从事败血症休克的机制及防治研究 ，并于1986年成立休克研究室。

    病理生理学科1977年、1981年先后获得硕士、博士授予权，1990年首批获准为病理生理学国家重点学科，1991年批准为基础医学博士后流动站，2000年批准为国家第四批长江学者奖励计划特聘教授岗位，2001年再次批准为病理学与病理生理学国家重点学科。

    目前，本室主要从事败血症休克和心血管病理生理学研究。近几年来在室主任和学科带头人肖献忠教授的领导下，将生命科学前沿领域的新思路和新技术与经典的病理生理学相结合，在心血管病相关基因克隆及其功能、全身炎症反应综合征、热休克蛋白的心血管保护作用等方面的研究达国际先进水平。