中南大学基础医学院医学微生物学系于1942年由著名的微生物学专家刘秉阳教授创建并任主任，1956年由吴洁如教授接任主持工作。几十年来，老一辈微生物学专家易有年、王慧、汪秀明、李沛涛、胡明杰、施凯、陈淑珍等为本学科的发展壮大，为教研室的建设做出了重大贡献并取得了一定的成果。1964年经批准又成立病毒研究室。

本学科是医学的重要基础学科之一。担任了学校各层次的医学微生物学的教学工作。培养了数以万计的医学专业人材。为本科五年制、七年制及八年制等各专业开设《医学微生物学》，为高师班及各科进修生班开设医学微生物学专题讲座，为研究生班开设《高级免疫学》专题讲座（未成立免疫学教研室前）、《分子病毒学》等选修课程。尤其在教学改革、教材建设方面成绩斐然。2002年及2003年连续两年中标“十五”国家重点音像出版规划教材（卫生部医学视听教材）3 部，并由人民卫生音像出版社出版，全国发行。主编和参编全国统编教材三册，编写出版专业书刊、专著 28 册，获教学各科奖 4 项。随着学科的发展，科研工作也不断进展。科研室人员曾获国家级科研项目7项，省级科研项目 20 余项。其中马王堆西汉古尸血型研究获全国科技大学奖，对湖南省的“乙脑”病毒及出血热病毒的研究获湖南省科技大会奖。并成功地分离和确定了湖南流行性出血热病毒（命名为湖南—79株）。国家自然科学基金课题《HD抗菌机理研究》获湖南省科技二等奖。HCMV致畸分子机制研究、HCMV先天性感染的受累基因及其功能性研究、HCMV致神经系统畸形的机制研究三项国家自然科学基金课题，总金额38万元。目前正在对HCMV致畸机制及病毒学检测、细菌、真菌耐药性机制进行了重点研究。

学科于1981年获得硕士学位授予权，共招收研究生50余人，承担过全国高师班师资培训，进修生的培养，提高专业人员水平，为国家培养了大批专业人材。

教研室现有职工15人，其中教授2人，副教授(或相当职称)9人，讲师2人，实验师1人，工人1人。 已获博士学位8人， 在读博士1人，在读硕士1人。1人任全国微生物学会理事、湖南省微生物学会理事长，4人任湖南省微生物学会理事，3人任聘国家级杂志编委、常务编委。现任主任夏忠弟，副主任陈利玉、刘水平，正带领全体成员为学科的进一步发展而拼搏。